Documentation de l'ETL

Dans cette section, vous trouverez les règles de transformation de la base principale du SNDS (Années 2015-2021) au format OMOP, V5.3 (opens new window) en langage naturel. Les descriptions des tables et variables présentes dans cette documentation sont tirées de la documentation OHDSI du modèle OMOP (opens new window).

Il est conseillé de traiter les tables dans l'ordre suivant :

• LOCATION
• CARE_SITE
• PERSON
• PROVIDER
• VISIT_OCCURRENCE
• STEM_TABLE
• VISIT_DETAIL
• OBSERVATION_PERIOD

Développement de l'ETL

• La section traitements préliminaires décrit les changements préalables qui ont été effectués sur les tables DCIR pour faciliter le développement de l'ETL.

• La section macros recense les principales macros utilisées lors du développement de l'ETL.

L'intégralité des scripts SQL effectuant la transformation de l'échantillon SNDS au format OMOP est disponible sur ce dépot GIT (opens new window).

WARNING

Ces travaux de transformation sont une version du SNDS au modèle OMOP. Des erreurs peuvent subsister et des choix peuvent être questionnés. N'hésitez pas à contribuer à l'amélioreration de l'ETLvia Gitlab ou en créant des tickets sur la documentation.

Accéder au code source

Le code source est disponible sur le dépôt Gitlab suivant (opens new window)