Ressources R

Cette fiche partage des ressources pour apprendre à utiliser R sur le portail CNAM et pour exploiter les données de la base principale (BP) du SNDS.

Les ressources listées ne se veulent pas exhaustives.
N'hésitez pas à contribuer en éditant directement la page ou en proposant une modification via un ticket (cf. section Guide de contribution).

Utiliser R sur le portail CNAM

Documentation de la Cnam

Dans la section BONNES PRATIQUES R de la documentation SNDS, régulièrement alimentée par la CNAM, vous trouverez :

• le Guide de bonnes pratiques
• une section dédiée au Partage de programmes

Autres ressources

Tutoriel "Pratiquer R sur le portail SNDS" d'un utilisateur de la DREES, qui complète le guide utilisateur de la Cnam

Programmes pour exploiter la BP du SNDS

Bibliothèque ouverte des algorithmes en santé (BOAS)

La BOAS recense des programmes tels que :

• La cartographie des pathologies et des dépenses, version G12 (opens new window) partagée par la Cnam
• Les SndsTools : développement de fonctions d’extraction paramétrables et réutilisables sur les périmètres les plus communs pour les études sur le SDNS (opens new window) qui ont été développés par plusieurs experts de la HAS, de l’Institut du Cerveau et et de l’APHM

Le GitLab de la HAS

La GitLab de la Haute Autorité de Santé (HAS) contient des programmes en langage R notamment dans les projets programmes-snds (opens new window) et acces_precoces (opens new window).

Pepidoc de Thomas Soeiro

Projet GitLab disponible au lien suivant : https://gitlab.com/soeiro/pepidoc (opens new window)