Domaine 'Drug exposure' - DCIR

Commentaires généraux

• Le fichier de correspondance entre les codes CIP7, UCD7. CIP13 et UCD13 se trouvent sur le serveur multi-terminologies l'ANS (opens new window).

• Le SNDS comporte à la fois des informations sur les médicaments vendus en pharmacie hospitalière (médicaments rétrocédés) et en ville.

Tables et variables du SNDS utilisées

_ER_UCD_F etb_pre_fin dcir_visit_id pre_pre_dtd quantity psp_spe_cod psp_act_nat ucd_ucd_cod

_ER_PHA_F etb_pre_fin dcir_visit_id pre_pre_dtd quantity psp_spe_cod psp_act_nat pha_prs_c13 pha_dos_unt_dses

Règles de transformation

Variable	Règle	Jointure		Filtre
		Gauche	Droite
id*	hash(source_value)
visit_occurrence_id	visit_occurrence_id de VISIT_OCCURRENCE	_ER_UCD_F ‘dciraa’ || ‘_’ || etb_pre_fin || ‘_’ || dcir_visit_id _ER_PHA_F ‘dciraa’ || ‘_’ || etb_pre_fin || ‘_’ || dcir_visit_id	VISIT_OCCURRENCE visit_occurrence_source_value
person_id*	person_id de VISIT_OCCURRENCE	cf jointure visit_occurrence_id
start_date*	_ER_UCD_F et _ER_PHA_F: pre_pre_dtd
start_datetime	start_date + ‘00:00:00’
end_date	_ER_UCD_F et _ER_PHA_F : pre_pre_dtd + 29 (Convention OMOP : la durée d’exposition par défaut est 30 jours quand la date de fin n’est pas connue)
end_datetime	end_date + ‘00:00:00’
type_concept_id*	32810
quantity	_ER_UCD_F et _ER_PHA_F: quantity
provider_id	provider_id de PROVIDER	_ER_UCD_F psp_spe_cod	PROVIDER provider_source_value	psp_spe_cod ≠ 99 and psp_spe_cod ≠0
		_ER_UCD_F psp_act_nat	PROVIDER provider_source_value	psp_act_nat ≠ 99 and psp_act_nat ≠0
		_ER_PHA_F psp_spe_cod	PROVIDER provider_source_value	psp_spe_cod ≠ 99 and psp_spe_cod ≠0
		_ER_PHA_F psp_act_nat	PROVIDER provider_source_value	psp_act_nat ≠ 99 and psp_act_nat ≠0
source_value	_ER_UCD_F : ucd_ucd_cod _ER_PHA_F : pha_prs_c13
source_concept_id	concept_id de CONCEPT	Jointure 1: (obtenir le code CIP-7 correspondant aux codes UCD-7 et CIP-13) _ER_UCD_F ucd_ucd_cod _ER_PHA_F pha_prs_c13	Jointure 1: correspondance cip_ucd code_ucd
		Jointure 2: (Obtenir le concept non standard défini par ATHENA qui correspond au code CIP-7) correspondance_cip_ucd codecip	Jointure 2: CONCEPT concept_code	Jointure 2: vocabulary_id = ‘BDPM’
concept_id*	concept_id_2 de CONCEPT_RELATIONSHIP	Jointure 1: (Obtenir le code CIP-7 correspondant aux codes UCD-7 et CIP-13) _ER_UCD_F ucd_ucd_cod _ER_PHA_F pha_prs_c13 Jointure 2: (Obtenir le concept non standard défini par ATHENA qui correspond au code CIP-7) correspondance_cip_ucd codecip Jointure 3: (Obtenir le concept standard RxNorm) CONCEPT concept_id	Jointure 1: correspondance cip_ucd code_ucd Jointure 2: CONCEPT concept_code Jointure 3: CONCEPT_RELATIONSHIP concept_id_1	vocabulary_id = ‘BDPM’ relationship_id = ‘Maps to’
domain_id	domain_id de CONCEPT s’il existe Sinon ‘Drug’	Jointure 1: (Obtenir le code CIP-7 correspondant aux codes UCD-7 et CIP-13) _ER_UCD_F ucd_ucd_cod _ER_PHA_F pha_prs_c13 Jointure 2: (Obtenir le concept non standard défini par ATHENA qui correspond au code CIP-7) correspondance_cip_ucd codecip Jointure 3: (Obtenir le concept standard) CONCEPT concept_id Jointure 4: (Obtenir le domain associé au concept standard) CONCEPT_RELATIONSHIP concept_id_2	Jointure 1: correspondance cip_ucd code_ucd Jointure 2: CONCEPT concept_code Jointure 3: CONCEPT_RELATIONSHIP concept_id_1 Jointure 4: CONCEPT concept_id	vocabulary_id = ‘BDPM’ relationship_id = ‘Maps to’
days_supply	30
dose_unit_source_ value	_ER_UCD_F : null _ER_PHA_F : pha_dos_unt_dses

Domaine 'Drug exposure' - PMSI

Le PMSI contient les médicaments de la liste en SUS délivrés dans le cadre d'une hospitalisation, les autres prises de médicament ne sont pas renseignées.

Tables et variables utilisées dans le SNDS

T_MCOaaFHSTC	T_HADaaMED	T_MCOaaMED	T_SSRaaMED eta_num rha_num	T_HADaaMEDATU	T_MCOaaMEDATU
	T_HADaaMEDCHL	T_MCOaaMEDTHROMBO	T_SSRaaMEDATU eta_num rha_num

Règles de transformation

Variable	Règle	Gauche	Droite	Filtre
id*	hash (source_value)
visit_occurrence_id	visit_occurrence_id de VISIT_OCCURRENCE	T_MCOaaFHSTC ‘mcoaaace’ || ‘_’ || eta_num || ‘_’ || seq_num T_HADaaMED ‘hadaa’ || ‘_’ || eta_num_epmsi || ‘_’ || rhad_num T_MCOaaMED ‘mcoaa’ || ‘_’ || eta_num || ‘_’ || rsa_num T_HADaaMEDATU ‘hadaa’ || ‘_’ || eta_num_epmsi || ‘_’ || rhad_num T_MCOaaMEDATU ‘mcoaa’ || ‘_’ || eta_num || ‘_’ || rsa_num T_SSRaaMED ‘ssr’ || ‘_’ || eta_num || ‘_’ || rha_num T_SSRaaMEDATU ‘ssr’ || ‘_’ || eta_num || ‘_’ || rha_num T_HADaaMEDCHL ‘hadaa’ || ‘_’ || eta_num_epmsi || ‘_’ || rhad_num T_MCOaaMEDTHROMBO ‘mcoaa’ || ‘_’ || eta_num || ‘_’ || rsa_num	VISIT_OCCURRENCE visit_occurrence_source_value
person_id*	person_id de VISIT_OCCURRENCE	cf jointure visit_occurrence_id
start_date*	visit_start_date de VISIT_OCCURRENCE + : T_MCOaaFHSTC : 0 T_HADaaMED : dat_delai T_MCOaaMED : delai T_SSRaaMED : dat_delai T_HADaaMEDATU : dat_delai T_MCOaaMEDATU : dat_delai T_SSRaaMEDATU : dat_delai T_HADaaMEDCHL : dat_delai T_MCOaaMEDTHROMBO : dat_delai
start_datetime	start_date + ‘00:00:00’
end_date	start_date
end_datetime	end_date + ‘00:00:00’
type_concept_id*	32810
quantity	On somme : T_MCOaaFHSTC : qua T_HADaaMED : adm_nbr T_MCOaaMED : adm_nbr T_SSRaaMED : adm_nbr T_HADaaMEDATU : adm_nbr T_MCOaaMEDATU : adm_nbr T_SSRaaMEDATU : adm_nbr T_HADaaMEDCHL : adm_nbr T_MCOaaMEDTHROMBO : adm_nbr sur : person_id, visit_occurrence_id, concept_id, source_concept_id, domain_id, provider_id, source_value, start_date, says_supply, end_date et dose_unit_source_value
provider_id	NULL
source_value	ucd_ucd_cod des tables des médicaments
source_concept_id	concept_id de CONCEPT	Jointure 1:(Obtenir le code CIP-7 correspondance au code UCD-7) tables des médicaments ucd_ucd_cod UNION table des médicaments ucd_ucd_cod	Jointure 1 : correspondance_cip_ucd codeucd UNION correspondance_cip_ucd codeucd13
		Jointure 2: (Obtenir le code non standard défini par ATHENA qui correspond au code CIP-7) correspondance_cip_ucd codecip	Jointure 2: CONCEPT concept_code	Jointure 2: vocabulary_id = ‘BDPM’
concept_id*	concept_id_2 de CONCEPT_RELATIONSHIP	Jointure 1:(Obtenir le code CIP-7 correspondance au code UCD-7) tables des médicaments ucd_ucd_cod UNION table des médicaments ucd_ucd_cod	Jointure 1 : correspondance_cip_ucd codeucd UNION correspondance_cip_ucd codeucd13
		Jointure 2: (Obtenir le code non standard défini par ATHENA qui correspond au code CIP-7) correspondance_cip_ucd codecip	Jointure 2: CONCEPT concept_code	Jointure 2: vocabulary_id = ‘BDPM’
		Jointure 3: (Obtenir le concept standard) CONCEPT concept_id	Jointure 3: CONCEPT_RELATIONSHIP concept_id_1	Jointure 3: relationship_id = ‘Maps to’
domain_id	domain_id de CONCEPT s’il existe Sinon ‘Drug’	Jointure 1: (Obtenir le code CIP-7 correspondance au code UCD-7) tables des médicaments ucd_ucd_cod table des médicaments ucd_ucd_cod	Jointure 1 : correspondance_cip_ucd codeucd correspondance_cip_ucd codeucd13
		Jointure 2: (Obtenir le code non standard défini par ATHENA qui correspond au code CIP-7) correspondance_cip_ucd codecip	Jointure 2: CONCEPT concept_code	Jointure 2: vocabulary_id = ‘BDPM’
		Jointure 3: (Obtenir le concept standard) CONCEPT concept_id	Jointure 3: CONCEPT_RELATIONSHIP concept_id_1	Jointure 3: relationship_id = ‘Maps to’
		Jointure 4: CONCEPT_RELATIONSHIP concept_id_2	Jointure 4: CONCEPT concept_id
days_supply	1
dose_unit_source_value	null